（一）公路
全市公路密度为 93.9公里 /百平方公里，公路里程 2400.106公里 （国道 128.041公里 ，省道 97.438公里 ，县道 427.585公里 ，乡道 816.394公里 ，村道 930.648公里 ），其中高速公路里程 54.374公里 、等级公路里程 1727.199公里 、有路面里程 2106.733公里 、高级路面 998.177公里 ；桥梁 327座，总长20747.4延米，其中特大桥4座，总长9713.3延米；隧道6道，共4372延米。
全市营业性运输车辆拥有量为 27397辆，其中客车1816辆，46410座位，出租车3437辆，17185座位，货车22144辆（其中集装箱拖头1460辆，农用车2243辆），货运吨位73088吨。
全市拥有道路运输业户总数 492家。按经营范围分，从事道路客运139家（含出租车客运），道路普通货运395家（其中集装箱运输企业124家），危险货物运输企业21家，道路运输服务企业128家，道路搬运装卸企业26家。维修企业751家（其中9家维修企业通过ISO9002质量认证）。
全市共开辟客运班线 189条，日发送8118班次，与上海、重庆、香港、广东、浙江、江西、四川、贵州、安徽、广西、湖南、江苏、湖北等13个省、市及省内各地区互通班车。全年完成旅客运输量3325.75万人次，比上年下降11.5%，旅客周转量239565.03万人公里，比上年下降7.8%，完成货物运输量1742.36万吨，比增2.45%，货物周转量177355.99万吨公里，比增1.43%。
（二）海港
厦门港是厦门海港口岸的载体，是我国对外贸易的重要口岸之一。
厦门港位于东经 118 ° 04 ′，北纬 24 ° 29 ′ , 地处上海、广州之间，面临广袤的台湾海峡，北距上海 561 海里 ，福州 320 海里 ，东距台湾基隆 222 海里 ，高雄 165 海里 ，台中 130 海里 ，南至广州 389 海里 ，香港 287 海里 。厦门港是我国东南沿海天然深水良港，港阔、水深、浪小、不冻、基本不淤，港湾掩护条件好，周围岛屿星罗棋布，形成天然防风屏障。港内航道全长 30 公里 ， 5 万吨轮船不受潮位限制可随时出入， 15 万吨级船舶可候潮进出。
厦门港是国家 20个重点货物主枢纽港和8大沿海集装箱干线港之一，也是海峡两岸直航试点港口之一。目前共有东渡、海沧、嵩屿、东部（刘五店、五通）、和平客运五个主要港区，港口岸线总长 154公里 ，规划深水岸线 26公里 ，锚地面积 38平方公里，港口水域面积340平方公里，规划陆域面积约30平方公里。厦门港已完成10万吨级航道二期工程，进港主航道设计底标高－14.0至－ 14.5米 ，第六代集装箱船可乘潮抵港，并配备了完善的水上船舶交通管理系统（ VTS）。到2003年底，厦门港拥有生产性泊位74个，其中万吨级以上深水泊位23个，综合通过能力4100万吨；其中集装箱专业化泊位11个，岸线长度2500多米，通过能力265万标箱，并配有500多台套现代化专用设备。
全港集装箱班轮航线达到 68条，其中外贸线55条、内支线4条、内贸线9条。全港 完成货物吞吐量3403.88万吨，比增24.48%；完成集装箱吞吐量233.10万标箱，比增32.87%；完成旅客吞吐量 48.78 万人次，比增2.37％。 港口货物吞吐量、集装箱吞吐量分别位居全国沿海港口第14位、第7位，集装箱吞吐量跻身全球30强。
全市共有独立核算营业性水运企业 35家，从业人员3453个。拥有国际航运企业7家，经营试点直航企业10家，从事厦金客运直航企业5家，国际船舶代理企业17家，国际船舶管理企业2家，境外航商驻厦分公司10家。拥有机动船舶367艘，15120座位，总吨位372165吨，其中100客位以上客船38艘，占客船总数的28.36%；万吨以上货船16艘，占货船总数的14.95%。 全年完成旅客运输量 361.76万人次，比上年下降0.34%；旅客周转量4012.99万人公里，比上年增长0.46%；完成货物运输量1069万吨，比上年增长11.38%；完成货运周转量3296498万吨公里，比上年增长27.00%。
（三）航空
1、厦门高崎国际机场
厦门高崎国际机场是厦门空港口岸的载体，位于厦门岛东北角海滨，距市区 12 公里 。该机场 1983 年建成 并对外开放 ， 1992--1996 年进行二期工程建设。 1997 年 3 月经国家民航总局批准，厦门高崎国际机场升级为 4E 级机场，可起降目前世界上各种大型飞机。厦门航空港年吞吐能力可达到 1000 万人次以上，高峰期国内每小时旅客吞吐能力达 4000 人次，国际每小时旅客吞吐能力达 1000 人次。
厦门机场占地总面积 518公顷 ，有一条 3400米 长、 60米 宽的沥青混凝土跑道和一条 3300米 长、 44米 宽的水泥滑行道及 7条联络道，停机坪面积达25万平方米，可同时停靠43架大中型飞机。候机楼面积达15. 1万平方米 。
2003年厦门机场新开通2条国际客运航线，并首度开放第五航权，开辟了厦门―芝加哥越洋货运航线，国际货运量跃升全国第四位。全年完成飞机总起降架次为54900次，比增3.80%，其中运输起降架次52533次，比增1.53%。全年完成旅客吞吐量429.65万人次，比增0.89%，居全国第11位，其中国内航线338.45万人次，比增2.93%；国际航线58.81万人次，比增11.13%；港澳地区航线32.68万人次，比上年下降25.89%。全年完成货物吞吐量15.02万吨，比增7.89%，其中国内航线8.66万吨，比增3.73%；国际航线4.93万吨，比增32.48%；港澳地区航线1.44万吨，比上年下降23.36%。 2003年度，厦门机场荣获全国“旅客话民航”机场用户满意优质服务奖第一名，年度全国实施用户满意工程先进机场，年度“旅客话民航”400-800万人次组用户评价第二名。
2、厦门航空公司
厦门航空公司成立于 1984年7月25日 ，是我国第一家企业化航空公司，经过 20年的努力，已发展成为一家拥有47亿元资产、经营国内国际航线百余条、年运输旅客近500万人次的中等规模的航空公司。现有厦门、福州、晋江、武夷山、杭州等五个飞行基地，并在30多个大中城市设立营业部或办事处。拥有27架波音系列飞机、总客座4046个。2003年，厦门航空公司克服“非典”冲击，生产经营取得良好业绩。全年完成运输总周转量5.6亿吨公里、旅客运输量490.7万人次、货邮运输量7.8万吨，分别比上年同期增长6.1％、3.6％和3.0％；客座率达67.7％、载运率达63.3％，分别比上年同期上升2.9和2.5个百分点。
（四）铁路
厦门铁路内与外福线、漳龙线、漳泉线等支线相连，对外通过鹰厦铁路干线贯通全国。 2003年，福厦铁路完成工程可行性研究报告，厦门铁路枢纽规划着手开展，为厦门铁路建设发展描绘了新的蓝图。
厦门火车站现开通固定客运线路 13对，到达北京、南京、上海、西安、重庆、杭州、广州、南昌等城市，并且开通了厦门至成都、兰州、汉西等五定班列，厦门至上海城际班列以及厦门至乌鲁木齐、北京等地的行包班列。全年完成铁路旅客到发总量550万人，比上年增长0.11%，其中发送量265万人，同比下降4.2%；到达量285万人，同比增长4.5%。铁路完成货物到发总量849.03万吨，比增13.82%，其中发送量完成322.51万吨，比增16.79%；到达量完成556.52万吨，比增10.90%。截止 2003年12月31日 ，厦门站实现安全行车 1992天，实现无职工责任重伤事故3888天。
（五）邮电
全市共有厦门电信、移动、联通、铁通、网通、邮政等六家运营主体，拥有固定市话 81.54万部、移动市话（小灵通）48.87万部，普及率达到60.83部/百人；移动电话110.31万部，普及率达到52.53部/百人；各类公共电话8.33万部，普及率达到39.67部/千人。
全年完成邮电业务总量 23.64亿元，比增16.05%，其中完成邮政业务总2.87亿元，比增18.81%，完成电信业务总量20.77亿元，比增15.58%。全年邮电系统完成固定资产投资8.95亿元，比增24.83％。